蛋白质相互作用网络度分布的概率模型
分子网络
2007-05-23 v1
摘要
许多生物和技术网络的度分布被描述为幂律分布。虽然度分布并不能刻画网络的所有方面,但人们常认为其函数形式包含了塑造该网络的潜在进化过程的重要线索。一般而言,度分布的函数形式是以临时性的方式确定的,明显的类幂律行为往往仅在有限的连接度范围内延伸。在此,我们应用形式化的模型选择技术来决定哪种概率分布最能描述蛋白质相互作用网络的度分布。与既往研究相反,这一明确定义的方法表明,许多分子网络的度分布往往用广受欢迎的幂律分布之外的分布来描述更为合适。这反过来表明,简单而优雅的模型未必有助于对复杂生物过程的定量理解。
引用
@article{arxiv.q-bio/0507005,
title = {Probability Models for Degree Distributions of Protein Interaction Networks},
author = {Michael P. H. Stumpf and Piers J. Ingram},
journal= {arXiv preprint arXiv:q-bio/0507005},
year = {2007}
}