蛋白质-蛋白质相互作用网络的结构研究

我们提出了一种基于蛋白质在酵母双杂交等实验中相互结合方式的人类蛋白质成对相互作用图底层结构的简单模型。我们表明，关于人类蛋白质相互作用的数据支持该模型。在该模型下，每个蛋白质连接数的频率不遵循幂律，这与已报道的大规模酵母双杂交筛选酵母蛋白质-蛋白质相互作用数据的行为相反。以类似于大规模酵母双杂交搜索中的采样方式，从我们用该模型生成的底层图中采样子图，得到的度分布与幂律有细微差异，并且比幂律本身更好地拟合观测数据。我们的结果表明，在采样子图中观测到的近似幂律行为并不意味着底层图遵循幂律。