蛋白质相互作用网络与生物学：论其联系
无序系统与神经网络
2015-01-06 v1
摘要
蛋白质相互作用网络(PIN)是可视化蛋白质组的常用手段。然而，PIN数据集已知存在噪声、不完整，并且受到用于检测蛋白质相互作用的实验方案的偏倚。本文旨在理解真实的蛋白质相互作用与使用最流行的实验技术（即 mass spectronomy (MS) 和酵母双杂交(Y2H)）获得的蛋白质相互作用数据集之间的联系。我们证明蛋白质相互作用网络最自然的邻接矩阵具有可分离形式，这推导出了度分布矩与短环数量之间的精确关系。这些关系提供了检验数据集可靠性的有力工具，并暗示了蛋白质与复合体相互招募的潜在生物学机制。
引用
@article{arxiv.1501.00662,
title = {Protein interaction networks and biology: towards the connection},
author = {Alessia Annibale and Anthony C. C. Coolen and Nuria Planell-Morell},
journal= {arXiv preprint arXiv:1501.00662},
year = {2015}
}
备注
38 pages, 10 figures