连续介质介质溶剂模型泊松方程的边界积分方法
chem-ph
2008-02-03 v1 化学物理
摘要
本文测试了一种用于描述复杂溶质在水中溶剂化自由能随几何形状变化的介质模型。我们阐述了这些问题的边界积分方法理论的一些基本方面。算法讨论的一个方面为更大规模溶质的类似精确数值求解提供了多重网格方法的基础,这些方法可能是必需的。其他算法方面的工作显示,如何将宏观表面(如解界面和膜)纳入模型中,以及如何直接转移到周期边界条件。该介质模型被发现能给出关于溶剂化自由能随溶质几何形状变化的有趣且有帮助的结果。然而,它通常显著高估了经典吸引性离子对的稳定性。就示例和算法考虑而言,我们对逐步引入溶剂结构的分子细节以扩展该连续介质模型作出了一些观察。
引用
@article{arxiv.chem-ph/9510003,
title = {Boundary Integral Methods for the Poisson Equation of Continuum Dielectric Solvation Models},
author = {L. R. Pratt and G. J. Tawa and G. Hummer and A. E. Garcia and S. A. Corcelli},
journal= {arXiv preprint arXiv:chem-ph/9510003},
year = {2008}
}
备注
presented at the Martin Karplus birthday symposium, 3/95; revtex with jpc.sty, 46 pages, 9 figures