基于抛物线近似的二态折叠分析 I：假设
软凝聚态物质
2016-05-11 v1
摘要
一个将自发折叠固定二态系统的变性态与天然态构象体视为受限在调和吉布斯能阱中的模型已被建立。在该模型假设下，变性态(DSE)与天然态(NSE)系综的吉布斯能函数由抛物线描述，反应坐标(RC)的平均长度由温度不变的变性剂m值给出。因此，沿RC的过渡态系综(TSE)的系综平均位置，以及TSE的系综平均吉布斯能，由DSE与NSE抛物线的交点决定。推导的方程使得平衡稳定性和速率常数能够根据DSE与NSE中构象体溶剂可及表面积的高斯分布均值与方差来合理化。讨论了该模型对蛋白质折叠的意义。
引用
@article{arxiv.1605.02762,
title = {Analysis of Two-State Folding Using Parabolic Approximation I: Hypothesis},
author = {Robert S. Sade},
journal= {arXiv preprint arXiv:1605.02762},
year = {2016}
}
备注
65 pages, 20 figures