弱自由能势垒下的双态折叠

我们给出对一个含 54 个氨基酸的模型蛋白的蒙特卡洛研究，该蛋白直接折叠至其天然三螺旋束状态，不形成任何明确的中间态。发现即使在折叠温度下，分隔该蛋白天然态与去折叠态的自由能势垒也是弱的。尽管如此，我们发现熔解曲线在良好近似下可用简单双态系统描述，且弛豫行为接近单指数。在超过单个螺旋重排时间的时间尺度上，沿各反应坐标的运动大致为扩散型。基于方势阱中扩散的简单估计将弛豫时间预测在两倍因子以内。