蛋白质折叠漏斗相关能量景观的统计力学

由聚合物约束和相互作用的局域性引起的能量相关性，加上预先指定存在一个特别低能态，为随机杂聚物的能量景观引入最小挫折方面提供了一种方法。由此产生的漏斗形景观同时表现出从熔融球态到折叠态的相变，以及球态中的杂聚物玻璃化转变。我们在自平均区域中模拟折叠转变，结合一个简单的塌缩理论，使我们能够用合适的反应坐标将折叠描述为双阱自由能面。观察到的势垒位置和高度随蛋白质序列长度、稳定性和温度变化的趋势，在该模型的背景下得到了解释。我们还讨论了引入显式合作多体相互作用所产生的新物理，这种相互作用可能源于侧链堆积和非加性疏水力。该模型预测了与模拟中看到的变性曲线相似的曲线。