高尔夫球场与漏斗形能量景观：马氏体中的蛋白质折叠概念
统计力学
2017-11-01 v1
摘要
我们利用蛋白质折叠能量景观概念，如高尔夫球场与漏斗，在三角到中心矩形、正方到斜方以及三角到斜方的无热马氏体参数区间下，通过系统的温度骤冷蒙特卡洛模拟研究再平衡。在骤冷至转变温度以下时，由高对称性母相奥氏体经自催化孪晶或弹性影印转变为低对称性产物相马氏体，其在温度-时间-转变相图中同时具有快速转变与孕育延迟。我们发现低温（高温）下的快速（孕育延迟）转变源于具有内部漏斗的负能态高尔夫球场边缘尺寸大（小）。在孕育态中，应变结构因子通过搜寻有限过渡路径进入布里渊区高尔夫球场，该路径在转变温度处闭合，并伴随对哈密顿能量标度和对数正态分布不敏感的 Vogel–Fulcher 发散，作为主导熵势垒的特征。熵势垒的跨越通过能量占据分布、蒙特卡洛接受率、热发射与内功来识别。上述思想此前已在标量序参数情形中提出。本文表明对矢量序参数也可得到类似结果。
引用
@article{arxiv.1710.11183,
title = {Golf-course and funnel energy landscapes: Protein folding concepts in martensites},
author = {N. Shankaraiah},
journal= {arXiv preprint arXiv:1710.11183},
year = {2017}
}