基于抛物线近似的两态折叠分析 III：FBP28 WW 的非阿伦尼乌斯动力学 第一部分
软凝聚态物质
2016-05-11 v1
摘要
一个将去折叠和天然构象视为限制在简谐吉布斯能阱中的模型，已被用于分析自发折叠的固定两态系统的非阿伦尼乌斯行为。结果表明在压力和溶剂恒定时：(i) 两态系统仅在有限温度范围内有物理定义；(ii) 不论一级序列、天然构象的3维结构、去折叠态中的残余结构以及折叠和去折叠速率常数的大小如何，当其去折叠构象为达到活化态而掩埋最少量的溶剂可及表面积(SASA)时，两态系统的平衡稳定性最大；(iii) 折叠和去折叠的吉布斯势垒不总是由活化焓和活化熵的不完全补偿引起；(iv) 反应态间热容的差源于溶剂壳尺寸和非共价相互作用两者；(v) 过渡态系综沿反应坐标(RC)的位置取决于RC的选择；以及(vi) 瞬态布居的反应态的原子结构不能从由其能量学受扰动引起的变化推断。
引用
@article{arxiv.1605.02754,
title = {Analysis of Two-State Folding Using Parabolic Approximation III: Non-Arrhenius Kinetics of FBP28 WW Part-I},
author = {Robert S. Sade},
journal= {arXiv preprint arXiv:1605.02754},
year = {2016}
}
备注
129 pages, 71 figures