寡核苷酸微阵列上杂交与杂交后行为的吸附模型
生物大分子
2009-11-10 v3
摘要
对Affymetrix拉丁方阵加标实验数据的分析表明，寡核苷酸微阵列上探针的特征荧光强度与加标RNA靶浓度通过双曲响应函数相关，通常被认为是Langmuir吸附等温线。此外，在高加标浓度下的渐近信号对于错配特征几乎总是低于其配对完全匹配特征。我们考察了微阵列表面杂交的若干理论吸附模型，发现它们一般无法解释完全匹配与错配特征的不同饱和响应。另一方面，我们发现在平衡杂交随后在杂交后洗涤阶段部分解离双链体的模型中可找到简单且一致的解释。
引用
@article{arxiv.q-bio/0411005,
title = {Adsorption models of hybridization and post-hybridisation behaviour on oligonucleotide microarrays},
author = {C. J. Burden and Y. Pittelkow and S. R. Wilson},
journal= {arXiv preprint arXiv:q-bio/0411005},
year = {2009}
}
备注
26 pages, 6 figures, some rearrangement of sections and some additions. To appear in J.Phys.(condensed matter)