为何癌基因中的突变等位基因频率在 0.40 附近达到峰值并迅速下降？
种群与进化
2016-04-26 v2
摘要
癌基因中的突变等位基因频率在 0.40 附近达到峰值并迅速下降。在本文中，我们解释了这一现象的原因。 invoking 我们模型中数学分析的一个关键结果，即反函数定理，我们将突变的选择压力估计为种系等位基因频率的函数。在致癌突变完全显性的情况下，预计该选择函数与突变等位基因的分布呈线性相关。我们通过调查各种癌症类型中癌基因突变的等位基因频率证明了这一点，验证了我们关于平均有效选择的模型。与适应度的群体遗传学模型一致，选择函数符合伽马分布曲线，准确描述了突变等位基因频率的趋势。虽然现有的选择方程解释了低等位基因频率下的进化，但我们的方程是完全显性下适用于所有频率的自然选择通用公式。我们表明，选择始终表现出线性行为，有利于显性等位基因相对于隐性等位基因频率的变化。此外，这些方程显示，在低显性等位基因频率下，选择对隐性等位基因表现为幂律行为。
引用
@article{arxiv.1604.04935,
title = {Why Mutant Allele Frequencies in Oncogenes Peak Around 0.40 and Rapidly Decrease?},
author = {Kasthuri Kannan and Adriana Heguy},
journal= {arXiv preprint arXiv:1604.04935},
year = {2016}
}
备注
Main article 6 pages. Contains Abstract, Main Article, 1 Supplementary Figure, 1 Supplementary Method. Supplementary Table (Supplementary Table 1) and MATLAB code available upon request