有限无性种群中稀有突变体的固定概率
种群与进化
2008-12-31 v3
摘要
突变体(mutator)是一种通过破坏 DNA 复制或修复的某些方面而增加全基因组突变率的等位基因。观察到使突变率增加约 100 倍的突变体会自发出现,并在自然种群以及 \textit{E. coli} 的长期实验室进化实验中达到高频率。原则上,突变体等位基因的固定受限于以下因素:(i) 与野生型背景中突变的竞争,(ii) 额外的有害突变负荷,以及 (iii) 随机遗传漂变。利用多位点模型并结合模拟与分析方法,我们研究了这三个因素对初始稀有突变体固定概率 的影响,将其表示为种群大小 、有益和有害突变率以及突变强度 的函数。当选择快于突变()时,我们基于扩散的 近似成功捕捉到了效应 (ii) 和 (iii)。这使我们能够预测突变体在进化上受到青睐的条件。令人惊讶的是,我们的模拟表明,对于强效应突变体,效应 (i) 通常很小。我们的结果与现有的实验室进化实验在半定量上一致,并提出了未来的实验方向。
引用
@article{arxiv.0801.4812,
title = {The fixation probability of rare mutators in finite asexual populations},
author = {C. Scott Wylie and Cheol-Min Ghim and David A. Kessler and Herbert Levine},
journal= {arXiv preprint arXiv:0801.4812},
year = {2008}
}
备注
46 pages, 8 figures