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扭转-弯曲耦合与双链DNA的扭转响应

软凝聚态物质 2017-06-01 v2 生物大分子

摘要

最近的磁镊实验报道了双链DNA的扭转响应与可扭转蠕虫状链模型预测之间的系统性偏差。本文通过解析结果和计算机模拟表明,如果引入扭转与弯曲之间的耦合,这些差异可以得到解决。我们得到扭转-弯曲耦合常数的估计值为 40 ±\pm 10 nm。我们的模拟与高分辨率磁镊扭矩数据吻合良好。尽管扭转-弯曲耦合的存在早在多年前就被预测(Marko and Siggia, Macromolecules 27, 981 (1994)),但其对DNA力学性质的影响迄今很大程度上未被探索。我们期望该耦合在DNA静力学和动力学的多个方面发挥重要作用。

关键词

引用

@article{arxiv.1603.00835,
  title  = {Twist-bend coupling and the torsional response of double-stranded DNA},
  author = {S. K. Nomidis and F. Kriegel and W. Vanderlinden and J. Lipfert and E. Carlon},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1603.00835},
  year   = {2017}
}

备注

6 pages, 3 figures, Supplemental Material included