弯曲诱导的扭转波与核小体 DNA 的结构
软凝聚态物质
2018-08-23 v2 生物物理
生物大分子
摘要
近期工作表明扭转-弯曲耦合在 DNA 微力学中起着重要作用。在此我们研究其对弯曲 DNA 的影响。我们给出了环形 DNA 最小能量形状的解析解，表明扭转-弯曲耦合诱导出正弦扭转波。该解与微型环的粗粒化模拟以及核小体 DNA 数据均极为吻合，后者以超螺旋构象弯曲并缠绕在组蛋白上。我们的分析表明，核小体 DNA 中观测到的扭转振荡——迄今归因于与组蛋白的相互作用——是自由弯曲 DNA 的固有特征，并且应在其他蛋白质-DNA 复合物中可观测到。
引用
@article{arxiv.1801.10005,
title = {Bend-Induced Twist Waves and the Structure of Nucleosomal DNA},
author = {Enrico Skoruppa and Stefanos K. Nomidis and John F. Marko and Enrico Carlon},
journal= {arXiv preprint arXiv:1801.10005},
year = {2018}
}