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扭转应力下DNA的扭矩传递系数

生物大分子 2015-06-05 v1 软凝聚态物质

摘要

近年来,由于纳米技术使得单分子的拉伸和扭转成为可能,超螺旋DNA性质的理解取得了显著进展。对这些实验的定量解释需要准确知道被操纵DNA内部的扭矩。本文论证,不可能将全部外部扭矩转移到双螺旋的扭转应力中,并且应该始终假设一个减小的扭矩传递系数(TTC<1)。这一论断符合简单的物理直觉,并得到了全原子分子动力学(MD)模拟结果的支持。根据MD,在近乎最优条件下观察到TTC约为0.8。达到更高值需要特殊努力,在实践中应该很困难。TTC可能部分解释了不同方法测量的DNA扭转刚度之间持续存在的差异。

关键词

引用

@article{arxiv.1207.2018,
  title  = {The torque transfer coefficient in DNA under torsional stress},
  author = {Alexey K. Mazur},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1207.2018},
  year   = {2015}
}

备注

5 pages, 4 figures. To appear in Phys. Rev. E