基于粗粒化蒙特卡洛模拟的蛋白质(CoVE)热变性研究
化学物理
2020-09-02 v1
摘要
通过粗粒化蒙特卡洛模拟研究了蛋白质(CoVE)构象的热响应。从其特定接触剖面中确认了三个不同的区段：N端、跨膜区和C端。研究发现回转半径(Rg)呈现出非单调的亚普适热响应：在天然相(低温区)加热时Rg减小，与之相反，在进一步升高温度直至在变性相饱和成无规线团之前，Rg持续增大。蛋白质的类球性指数(有效维数的度量)随着蛋白质从球状构象变性为无规线团构象而降低。
引用
@article{arxiv.2009.00049,
title = {Thermal denaturation of a protein (CoVE) by a coarse-grained Monte Carlo simulation},
author = {R. B. Pandey},
journal= {arXiv preprint arXiv:2009.00049},
year = {2020}
}
备注
9 pages, 5 figures