单结构域蛋白内变构信号传导的速度
生物物理
2021-04-28 v2
摘要
尽管人们对不同的变构调控机制已有较多了解，但“变构信号”的本质及其传播的时标仍不清楚。来自突触后密度-95 蛋白的 PDZ3 结构域是一个小的蛋白结构域，其末端第三α螺旋——即 3-螺旋，已知具有变构活性。通过将变构螺旋与偶氮苯基团交联，我们获得了一种光可控的 PDZ3 变体。光开关触发其变构转变，导致肽段与远端结合口袋结合亲和力的改变。利用时间分辨红外和紫外/可见光谱，我们追踪了变构信号转导，并重建了变构信号在 200 ns 内穿过蛋白传播的时间线。
引用
@article{arxiv.2103.10719,
title = {The Speed of Allosteric Signaling Within a Single-Domain Protein},
author = {Olga Bozovic and Jeannette Ruf and Claudio Zanobini and Brankica Jankovic and David Buhrke and Philip J. M. Johnson and Peter Hamm},
journal= {arXiv preprint arXiv:2103.10719},
year = {2021}
}