DNA介导变构的机理
统计力学
2024-01-11 v2 生物大分子
摘要
蛋白质常通过变构——或称远距离作用——调控其活性，即一个结合位点配体的结合影响远端位点对另一配体的亲和力。尽管不如蛋白质中研究广泛，DNA中的变构效应也已在实验中被观察到。这些实验中，两个或多个蛋白质结合于不同DNA位点，并经由连接DNA分子介导的机理彼此间接作用。我们发展了DNA/蛋白质相互作用的力学模型，预言了三种不同的变构机理。其中两种涉及焓介导的变构，第三种由熵驱动。我们分析了DNA变构实验，并凸显可借以识别所提机理中哪一种最符合数据的特征性标志。
引用
@article{arxiv.2305.03962,
title = {Mechanisms of DNA-mediated allostery},
author = {Midas Segers and Aderik Voorspoels and Takahiro Sakaue and Enrico Carlon},
journal= {arXiv preprint arXiv:2305.03962},
year = {2024}
}