单态与多态变构的出现机制
生物大分子
2021-11-19 v1 种群与进化
摘要
已有若干物理机制被提出用以解释蛋白质中的变构现象。这些机制的区别在于它们假定蛋白质所占据的内部状态数目不同，从而留下了一个悬而未决的问题：是什么控制着这些不同物理形式变构的出现。在此，我们分析了一个在一系列物理与进化约束下的简化蛋白质变构模型。我们发现，两种原型机制可以通过进化涌现：一种是单态机制，即配体结合沿一个软简正模式诱导位移；另一种是多态机制，即配体结合跨越能垒切换到不同的稳定态。重要的是，只要两种机制均可能，多态机制就会赋予更强的变构效应，从而带来选择优势。本工作界定了单态或多态变构的基本约束，并为变构进化起源的物理理论奠定了基础。
引用
@article{arxiv.2111.09377,
title = {On the emergence of single versus multi-state allostery},
author = {Eric Rouviere and Rama Ranganathan and Olivier Rivoire},
journal= {arXiv preprint arXiv:2111.09377},
year = {2021}
}