熵变构的粗粒化模型

分子生物学中的许多信号功能要求蛋白质响应环境信号(如同时结合小分子)而结合底物如DNA。阻遏蛋白即为例证，其可通过响应配体结合的构象变化传递信息。另一种“变构”的熵机制表明，诱导配体改变分子内振动熵，而不仅仅是静态结构。我们提出一个定量的粗粒化熵变构模型，其给出了利用此效应的蛋白质内部内聚势的设计规则。它还探讨了结合或解离的信号信息如何通过蛋白质传递的问题。该模型可适用于广泛的阻遏蛋白以及跨膜蛋白中的信号传导。