多结构域蛋白质中跨分子尺度动力学的起始
生物大分子
2025-05-21 v2 生物物理
摘要
蛋白质动力学已在广泛的时间尺度上得到研究。纳秒与皮秒动力学被归因于局部涨落，而更慢的动力学则源于更大的构象变化。然而，局部涨落如何导致全局变构变化在很大程度上仍属未知。本文表明，100 ns时间尺度上的跨分子尺度动力学先于更大的变构变化出现。我们通过结合单分子荧光、准弹性中子散射和全原子分子动力学（MD）模拟，将全局实空间运动归属于100 ns时间尺度上的动力学模式。此外，我们展示了Hsp90的辅助伴侣蛋白Sba1对这些跨分子尺度动力学的影响，这意味着此类动力学具有功能重要性。我们的综合方法为多结构域蛋白质的纳秒时间尺度跨分子尺度动力学提供了全面见解，并表明此类动力学是蛋白质变构与大幅构象变化的分子基础。
引用
@article{arxiv.2110.10483,
title = {The onset of molecule-spanning dynamics in a multi-domain protein},
author = {Benedikt Sohmen and Christian Beck and Tilo Seydel and Ingo Hoffmann and Bianca Hermann and Mark Nüesch and Marco Grimaldo and Frank Schreiber and Steffen Wolf and Felix Roosen-Runge and Thorsten Hugel},
journal= {arXiv preprint arXiv:2110.10483},
year = {2025}
}
备注
29 main text pages, 7 main text figures; 27 SI pages, 15 SI figures