chiPower 变换:成分数据分析中 logratio 变换的有效替代
统计方法学
2024-02-29 v3
摘要
成分数据分析方法一直由 logratio 变换主导,以确保精确的子成分连贯性,且在某些情况下确保精确的等距性。该方法的一个问题是,大多数应用中存在的数据零值必须被替换才能允许对数变换。一种称为“chiPower”变换的替代新方法允许数据零值,它将对应分析中卡方距离固有的标准化与 Box-Cox 幂变换的基本要素相结合。chiPower 变换的合理性在于,对于严格正数据,它定义样本间距离在幂参数趋于零时趋于 logratio 距离,从而等价于变换为 logratio。对于含零数据,可确定一个幂值使 chiPower 变换尽可能接近 logratio 变换,而无需替换零值。尤其在高位数据领域,该替代方法可呈现如此高的连贯性与等距性,使其成为成分数据分析的有效方法。此外,在有监督学习语境中,若成分变量作为建模框架中(例如广义线性模型)对响应的预测变量,则幂可作为调优参数通过交叉验证优化预测精度。chiPower 变换后的变量有直白解释,因为它们各自与单一成分部分而非比率对应。
引用
@article{arxiv.2211.06755,
title = {The chiPower transformation: a valid alternative to logratio transformations in compositional data analysis},
author = {Michael Greenacre},
journal= {arXiv preprint arXiv:2211.06755},
year = {2024}
}
备注
12 figures (incl. figures in supplementary material) and 1 table. This is a revision of the second version of the paper