谱图与生物数据的表示和解释
定量方法
2012-10-19 v1
摘要
识别特征性质是生物学及其他领域的基本问题，这些性质一方面为特定领域的结构（如基因调控、蛋白质-蛋白质相互作用、神经网络或食物网）所共有，另一方面又能将其与其他结构区分开来。我们引入并应用了一种基于归一化图拉普拉斯算子谱的一般方法，该方法产生的表示（即谱图）使我们能够系统地发现并可视化此类性质。我们展示了广泛生物网络的此类可视化结果，并将其与源自理论框架的网络可视化结果进行了比较。我们发现的差异十分显著，并表明对生物网络普适性质的探索，应当辅以对不同尺度下生物组织原则更具体特征的理解。
关键词
引用
@article{arxiv.0706.1198,
title = {Spectral plots and the representation and interpretation of biological data},
author = {Anirban Banerjee and Jürgen Jost},
journal= {arXiv preprint arXiv:0706.1198},
year = {2012}
}
备注
15 pages, 7 figures