拉普拉斯谱与蛋白质 - 蛋白质相互作用网络
定量方法
2007-05-24 v1 数据分析、统计与概率
种群与进化
摘要
从(归一化)图拉普拉斯算子的谱图中,可以同时推导出网络的基本定性性质。给定一类实证网络,随后可开发重构方案以阐明导致这些特定数据的进化动力学。本文以蛋白质 - 蛋白质相互作用网络为例说明了该方法。我们识别出了其复制和分歧过程进化历史的痕迹。特别是,尽管底层数据可能存在统计波动,我们仍能识别出典型的特定特征,从而稳健地将蛋白质 - 蛋白质相互作用网络与其他类网络区分开来。
引用
@article{arxiv.0705.3373,
title = {Laplacian Spectrum and Protein-Protein Interaction Networks},
author = {Anirban Banerjee and Jürgen Jost},
journal= {arXiv preprint arXiv:0705.3373},
year = {2007}
}
备注
7 pages, 3 figures