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共享祖先图与符号树状映射

组合数学 2023-08-14 v1 离散数学

摘要

有限集XXX2|X|\geq 2)上的网络NN是一个连通有向无环图,其叶集为XX,其中NN中每个根的出度至少为2,且NN中没有顶点的入度和出度都等于1;NN若是树状网络,则其底层无根无向图是一棵树。网络在进化生物学中备受关注,因为它们被用于例如表示一组物种XX的进化历史,这些物种的祖先在过去曾交换过基因。对于某个任意符号集MMd:(X2)M{}d:{X \choose 2} \to M \cup \{\odot\}是一个符号树状映射,如果存在某个树状网络NN,其出度不小于2的顶点由MM中元素标记,并且对于x,y(X2){x,y} \in {X \choose 2}d({x,y})d(\{x,y\})等于NNxxyy的最近公共祖先的标记(若存在)否则为\odot。符号树状映射的重要例子包括符号超度量,它们出现在博弈论、系统发育学和余图理论等领域。在本文中,我们证明映射d:(X2)M{}d:{X \choose 2} \to M \cup \{\odot\}是符号树状映射,当且仅当dd满足某些3点和4点条件,且以XX为顶点集、边集由那些满足d({x,y})d(\{x,y\}) \neq \odotx,y(X2){x,y} \in {X \choose 2}组成的图是托勒密图。为此,我们引入并证明了一个关于XX上网络NN的共享祖先图的关键定理,其中共享祖先图是以XX为顶点集、边集由那些x,y(X2){x,y} \in {X \choose 2}组成的图,使得xxyyNN中共享一个公共祖先。特别地,我们证明对于任意以XX为顶点集的连通图GG及其边团覆盖KK(其中KK中不存在两个不同的集合使一个为另一个的子集),存在某个具有K|K|个根且叶集为XX的网络,其共享祖先图即为GG

关键词

引用

@article{arxiv.2308.06139,
  title  = {Shared ancestry graphs and symbolic arboreal maps},
  author = {Katharina T. Huber and Vincent Moulton and Guillaume E. Scholz},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2308.06139},
  year   = {2023}
}

备注

19 pages, 5 figures