准物种模型中的半保留复制 II：对任意损伤修复概率的推广

本文将半保留准物种方程推广以考虑任意复制后损伤修复效率。这种推广可作为理解癌症发展和干细胞生长等过程的重要工具。从基因组空间上的准物种动力学出发，我们推导了有序序列对空间上的等价动力学。由这组方程，我们得以推导基于一类“主基因组”的适应度景观动力学的无限序列长度形式。我们利用这些方程求解了“广义”单适应度峰景观，其中主基因组可承受最大数量的损伤并保持存活。我们研究中浮现的核心模式是：不完美的损伤修复常导致比完全有效损伤修复的半保留复制具有更高的突变鲁棒性。其原因是不完美的损伤修复打破了亲本链与子代链之间的一些相关性，从而防止复制错误破坏原始基因组中的信息。结果是误差灾变相较于原初半保留准物种模型的预期被延迟。特别地，我们表明当仅有一条链为赋予存活能力所必需时，若关闭损伤修复，半保留复制系统便成为本质上保守复制的系统。