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多倍体基因组的半保留准种方程:一般情形

种群与进化 2015-05-14 v1 基因组学

摘要

本文发展了适用于多倍体、半保留复制基因组的准种方程形式。本文是先前关于该主题工作的扩展,先前工作考虑了单倍体基因组的情形。在此,我们发展了一个更一般的准种方程形式,适用于二倍体甚至多倍体基因组。有趣的是,通过对群体分数进行适当分类,我们得到了一个形式上与单倍体情形相同的方程组。与单倍体基因组的工作一样,我们同时考虑了随机和永生DNA链染色体分离机制。然而,与单倍体情形相反,我们发现对于多倍体情形,平均适应度的解析解要难获得得多。因此,对于单倍体情形,我们在任意损伤修复概率(从而允许非互补基因组)下,得到了单适应度峰景观类似物的平均适应度表达式;而在此,我们针对完美损伤修复的受限情形求解了平均适应度。

引用

@article{arxiv.0912.4714,
  title  = {Semiconservative quasispecies equations for polysomic genomes: The general case},
  author = {Eran Itan and Emmanuel Tannenbaum},
  journal= {arXiv preprint arXiv:0912.4714},
  year   = {2015}
}

备注

16 pages, 3 figures