前生物进化置换不变 Crow-Kimura 模型的线性代数
种群与进化
2014-08-21 v3
摘要
本文研究了著名的准种模型的一个特例——具有置换不变适应度景观的 Crow-Kimura 模型。利用置换不变适应度景观下突变矩阵具有特殊三对角形式这一事实,我们提出了一种基变换,使得在新坐标系中可以获得若干解析结果。特别是,利用突变矩阵的特征向量作为新基,我们证明了准种分布趋近于二项分布,并给出了收敛速度的简单估计。所提方法的另一个推论是确定了准种的方程组的参数解。利用该参数解,我们表明在某些现有方法未涵盖的情况下,我们的方法能导出精确的渐近结果。特别是,我们不仅能给出主特征值(平均种群适应度)的极限行为,还能给出特殊情况下极限准种特征向量的精确公式。例如,在经典的单峰适应度景观情况下,该特征向量服从几何分布。在生物学方面,我们基于准种与二项分布的接近程度提出了一个数学定义,可用作著名的误差阈值的操作性定义。利用该定义,我们提出了两个近似公式来估计发生准种离域后的临界突变率。
引用
@article{arxiv.1306.0111,
title = {Linear algebra of the permutation invariant Crow-Kimura model of prebiotic evolution},
author = {Alexander S. Bratus and Artem S. Novozhilov and Yuri S. Semenov},
journal= {arXiv preprint arXiv:1306.0111},
year = {2014}
}
备注
35 pages. Several changes are incorporated and one reference is added