RNA 变性:排斥体积、假结节及相变情景
软凝聚态物质
2007-05-23 v1 q-bio
摘要
提出了一种 RNA 变性的格子模型,完全考虑了核苷酸之间排斥体积效应。数值研究表明,必须包括构成假结节 (pseudoknots) 的相互作用,才能得到尖锐的连续相变。否则,将发生从膨胀线性聚合物行为向高度分支、接近致密构象的平滑交叉过程。在后者情景下(当这些结构远比假结节链接更稳定时),循环和主分支长度的概率分布遵循非经典指数的尺度律。
引用
@article{arxiv.cond-mat/0303226,
title = {RNA denaturation: excluded volume, pseudoknots and transition scenarios},
author = {M. Baiesi and E. Orlandini and A. L. Stella},
journal= {arXiv preprint arXiv:cond-mat/0303226},
year = {2007}
}
备注
4 pages 3 figures