含碰撞诱导核糖体脱落的 mRNA 翻译排斥模型

信使 RNA 转录本到蛋白质的翻译通常被建模为具有扩展粒子的二维完全不对称排斥过程。此处我们关注因核糖体不可逆脱离而导致的翻译提前终止效应。我们考虑一种模型，其中脱离由向被占据位点移动的不成功尝试所诱导。该模型在由翻译起始区后接代表翻译瓶颈的单个慢位点组成的简化几何中可精确求解。与近期实验与计算研究一致，我们发现核糖体流对起始速率呈非单调依赖，但仅当碰撞对中的前导粒子脱离时成立。模拟表明该效应在更大晶格与扩展瓶颈下持续存在。在均匀系统中，核糖体密度随距起始位点距离呈逆平方根渐近衰减。