mRNA翻译的半马尔可夫模型
分子网络
2011-04-04 v1 统计力学
生物物理
摘要
翻译是核糖体根据信使RNA(mRNA)上编码的信息制造蛋白质的细胞过程。我们利用排他过程对翻译进行建模,考虑了实验测定的核糖体各步之间非指数的等待时间。通过使用现实参数值进行数值模拟,我们确定了一条mRNA所产生的蛋白质数量E的分布P(E)。我们发现,对于较小的E,该分布并非几何分布。我们提出了一个简化的且可解析求解的半马尔可夫模型,该模型将P(E)与产生前E个蛋白质所需时间的分布联系起来。
引用
@article{arxiv.1104.0131,
title = {Semi-Markov models of mRNA-translation},
author = {Mieke Gorissen and Carlo Vanderzande},
journal= {arXiv preprint arXiv:1104.0131},
year = {2011}
}
备注
4 pages, 5 figures