破译蛋白质产生速率的 mRNA 序列决定因素

翻译生物物理模型面临的最大挑战之一是识别影响翻译速率进而影响细胞内整体蛋白质产生的编码序列特征。我们提出了一种解析方法来求解基于非均匀完全非对称简单排他过程的翻译模型，这使我们能够揭示决定蛋白质产生速率的核苷酸序列的简单设计原理。与 S. cerevisiae 转录本序列的全基因组数值模拟相比，我们的解表现出极好的一致性，并预测前 10 个密码子连同起始速率的值是蛋白质产生速率的主要决定因素。最后，我们基于密码子选择在调控翻译速率和核糖体密度方面的进化作用，对所获得的解析结果进行了解释。