aa-tRNA竞争对有效翻译效率至关重要
分子网络
2020-02-18 v1 亚细胞过程
摘要
翻译是一个核心的生物过程，通过它蛋白质由mRNA中包含的遗传信息合成。本文中，我们通过随机模拟模型在分子水平研究翻译的动力学。该模型明确包含RNA序列、核糖体动力学、tRNA库以及翻译延伸中的生化反应。结果表明，翻译效率主要受限可用核糖体数量、翻译起始和翻译延伸时间。延伸时间服从对数正态分布，其均值和方差由密码子饱和度以及每个密码子结合处的aa-tRNA选择过程共同决定。此外，我们的模拟显示翻译准确性随序列长度呈指数下降。这些结果表明aa-tRNA竞争对翻译延伸、翻译效率以及准确性都至关重要，进而决定了正确蛋白质的有效生产速率。我们的结果利用一个延迟微分方程改进了蛋白质生产的动力学方程，该方程通过有效生产速率和延伸时间分布依赖于序列信息。
引用
@article{arxiv.1504.00621,
title = {aa-tRNA competition is crucial for the effective translation efficiency},
author = {Wenjun Xia and Jinzhi Lei},
journal= {arXiv preprint arXiv:1504.00621},
year = {2020}
}
备注
8 pages, 10 figures