microRNA 对蛋白质翻译过程作用的动力学建模
分子网络
2010-03-09 v1 生物大分子
定量方法
摘要
蛋白质翻译是一个多步骤过程，可以表示为一系列生化反应（起始、核糖体组装、延伸等），其速率可以通过多种机制由小的非编码 microRNA 调控。目前尚不清楚哪些 microRNA 作用机制最为主要；此外，许多实验报告对于实验中实际观察到的具体机制传递了相互矛盾的信息。Parker 和 Nissan (Parker and Nissan, RNA, 2008) 证明，利用蛋白质合成速率的稳态数据无法区分不同的生物学假说。他们的分析使用了两个简单的蛋白质翻译动力学模型。相反，我们表明动力学数据能够区分某些 microRNA 作用机制。我们使用与 (Parker and Nissan, RNA, 2008) 中相同的模型进行演示，以便比较，但所开发的方法（生化网络渐近学）也可用于其他模型。作为我们分析的结果之一，我们提出一个假说：只有当 microRNA 的作用影响蛋白质翻译机制的主导系统（复杂网络中限速步骤概念的推广）时，其效果才是可测量和可观察的。主导系统在不同的实验条件下可能发生变化，这可以部分解释某些实验数据中存在的争议。
引用
@article{arxiv.0911.1797,
title = {Dynamical modeling of microRNA action on the protein translation process},
author = {Andrei Zinovyev and Nadya Morozova and Nora Nonne and Emmanuel Barillot and Annick Harel-Bellan and Alexander N. Gorban},
journal= {arXiv preprint arXiv:0911.1797},
year = {2010}
}
备注
submited to BMC Syst Biol