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蛋白质-DNA相互作用的动力学:首达分析

亚细胞过程 2018-04-27 v1

摘要

所有生命系统都只能远离平衡态运作,因此化学动力学方法对于揭示生物过程的机制至关重要。在此我们提出一种研究蛋白质-DNA相互作用动力学的新理论方法,该类相互作用支配着所有主要生物过程。它基于对生化和生物物理转变的首达分析,并对这些过程提供完全解析的描述。我们以单个蛋白质在 DNA 上搜索特定结合位点的情况说明了我们的方法。此外,还讨论了该方法在考察 DNA 序列异质性影响以及多个靶标与陷阱在蛋白质搜索动力学中作用方面的应用。

关键词

引用

@article{arxiv.1804.10114,
  title  = {Kinetics of Protein-DNA Interactions: First-Passage Analysis},
  author = {Maria P. Kochugaeva and Alexey A. Shvets and Anatoly B. Kolomeisky},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1804.10114},
  year   = {2018}
}

备注

17 pages; 7 figures