非病毒基因转移的预测建模
定量方法
2010-02-16 v1 亚细胞过程
摘要
在非病毒基因递送中，转基因表达的方差源于成功转移的质粒数量少。在这里，我们通过单细胞延时分析实验确定了Lipofectamine和PEI介导的外源基因表达分布。当与同步化细胞系一起使用时，两种转染试剂均观察到宽泛的类泊松稳态表达分布。同时，与YFP和CFP编码质粒的共转染分析表明，多个质粒同时表达，提示质粒以相关单元（复合物）的形式递送。我们提出了一个转染的数学模型，其中假设了一个随机两步过程：第一步是复合物进入细胞核的低概率步骤，随后是递送复合物中少量质粒的释放和激活。这个概念上简单的模型一致地预测了观察到的转染细胞比例、共转染比率和表达水平分布。它给出了每个复合物中有效质粒的数量，并阐明了相关噪声的来源，从而为评估和改进非病毒载体提供了一个平台。
引用
@article{arxiv.1002.2644,
title = {Predictive Modeling of Non-Viral Gene Transfer},
author = {Gerlinde Schwake and Simon Youssef and Jan-Timm Kuhr and Sebastian Gude and Maria Pamela David and Eduardo Mendoza and Erwin Frey and Joachim O. Rädler},
journal= {arXiv preprint arXiv:1002.2644},
year = {2010}
}
备注
20 pages, 6 figures, 12 pages supporting information