人类基因组中转座子的随机捕食者-猎物动力学
种群与进化
2016-11-16 v2 生物物理
基因组学
摘要
可转座元件，或称转座子，是在细胞生命周期中可以从基因组中的一个位点跳跃到另一个位点的 DNA 序列，通常编码执行其自身切除的酶。然而，一些转座子是寄生的，依赖于常规转座子产生的酶。在这种情况下，我们表明，考虑了细胞内转座子拷贝数较小的随机模型预测了噪声诱导的捕食者-猎物振荡，其特征时间尺度远长于细胞复制时间，这表明捕食者-猎物振荡器的状态被储存在基因组中并传递给连续的世代。我们的工作证明了数量涨落可移动遗传元件表达中的重要作用，并明确展示了生态学概念如何应用于活基因组的动力学和涨落。
引用
@article{arxiv.1609.04136,
title = {Stochastic predator-prey dynamics of transposons in the human genome},
author = {Chi Xue and Nigel Goldenfeld},
journal= {arXiv preprint arXiv:1609.04136},
year = {2016}
}