质粒长度分布的简单模型
种群与进化
2014-11-04 v1
摘要
质粒是水平基因转移机制的主要参与者,因此其基因内容和长度高度可变。我们提出了一个质粒适应度与其长度关系的模型,该模型预测收益递减。我们通过一个简单的演化模型推断出质粒长度的分布,并表明接合机制的存在及其效率与质粒长度之间存在正相关。该模型预测质粒上存在“插入负荷”,这也可以解释为何质粒在细菌种群中广泛存在却很少固定下来。最后,我们讨论了质粒的典型长度如何随环境压力增加而增加,重点关注近期人类驱动的抗生素浓度升高。
引用
@article{arxiv.1411.0297,
title = {A simple model for the distribution of plasmid lengths},
author = {Alice Ledda and Luca Ferretti},
journal= {arXiv preprint arXiv:1411.0297},
year = {2014}
}
备注
8 pages, 8 figures