质粒接合速率估计与报告指南
种群与进化
2023-03-03 v1
摘要
接合是质粒生物学的核心特征，也是细菌中水平基因转移的重要机制。然而，对于如何准确估计和报告质粒接合速率，学界鲜有共识，部分原因在于可用方法种类繁多。鉴于各方法间的相似性，我们提出了质粒接合实验的通用报告指南。这些指南基于近期关于质粒接合及接合速率测量方法的文献，构成了最佳实践。除通用指南外，我们讨论了现有接合速率估计方法背后的常见理论假设，并就如何避免违背这些假设给出了建议。我们希望这能有助于接合速率测量的实施与评估，并引发关于量化质粒接合速率实践的更广泛讨论。
引用
@article{arxiv.2303.00803,
title = {Guidelines for the estimation and reporting of plasmid conjugation rates},
author = {Olivia Kosterlitz and Jana S. Huisman},
journal= {arXiv preprint arXiv:2303.00803},
year = {2023}
}