具有扩散各向异性的能量景观中反应坐标的预测
化学物理
2017-08-01 v2 材料科学
软凝聚态物质
统计力学
计算物理
摘要
我们考虑了一系列具有亚稳态的模型势，其在高摩擦区下与热浴耦合进行分子动力学模拟，并探讨最优反应坐标如何依赖于扩散各向异性。为此，我们使用最近提出的方法“序参量谱隙优化（SGOOP）”（Tiwary and Berne, Proc. Natl. Acad. Sci. 113 2839 2016）。我们展示了如何将关于动力学可观测量与静态信息相结合的可用信息纳入SGOOP，从而可用于准确确定任意各向异性下的“最佳”反应坐标。我们将我们的结果与透射系数计算以及已发表的基准（在适用或可得处）进行比较。
引用
@article{arxiv.1704.03912,
title = {Predicting reaction coordinates in energy landscapes with diffusion anisotropy},
author = {Pratyush Tiwary and B. J. Berne},
journal= {arXiv preprint arXiv:1704.03912},
year = {2017}
}