聚合酶/切刻酶驱动的双模板多循环 G-三链体机器用于 HIV-1 测定
定量方法
2020-06-30 v1
摘要
我们提出了一种由聚合酶与切刻酶驱动、具有高效率的双模板多循环 DNA 纳米机器。该反应体系仅由两种模板（T1、T2）与两种酶（KF 聚合酶、Nb.BbvCI）组成。两种模板结构相似（X-X-Y、Y-Y-C）：包含引物识别区、引物类似物生成区、输出区（3 至 5），且每两个区域之间有一个切刻位点。T1 的输出作为 T2 的引物，富含 G 的片段（G3）被设计为最终产物。在 HIV-1 存在时，由于多循环扩增策略生成了大量 G3，并在加入硫黄素 T（ThT）后形成 G-三链体 ThT 复合物，在无标记传感策略中作为信号报告物大幅增强了荧光强度。该多循环 G-三链体机器可实现 50 fM-2 nM 的 HIV-1 基因检测动态响应范围，且得益于高效扩增策略，酶促反应可在 45 分钟内完成并进行荧光测量。此外，通过替换模板序列可实现对其他靶标的分析。因此，该策略在痕量生物标志物分析方面具有一定应用潜力。
引用
@article{arxiv.2006.15548,
title = {Polymerase/nicking enzyme powered dual-template multi-cycled G-triplex machine for HIV-1 determination},
author = {Qiuyue Duan and Qi Yan and Yuqi Huang and Wenxiu Zhang and Shuhui Zhao and Gang Yi},
journal= {arXiv preprint arXiv:2006.15548},
year = {2020}
}
备注
16 pages, 7 Postscript figures, 3 tables