面向短DNA片段的全电式单分子杂交检测器
软凝聚态物质
2018-08-06 v1 生物物理
生物大分子
摘要
通过结合DNA纳米技术与纳米移液管中的高带宽单分子检测，我们展示了一种用于短DNA序列（< 100 nt）的全电、无标记杂交传感器。已知此类短片段作为游离细胞DNA（circulating cell-free DNA）出现在血液血浆和唾液等多种体液中，并已被确定为癌症和传染病的疾病标志物。为此，我们采用结核分枝杆菌中RV1910c基因的88-mer靶标作为模型系统，该基因与结核病中的抗生素（异烟肼）耐药性相关。在结合到连接长载体DNA的短探针后，我们表明纳米移液管中的电阻脉冲传感能够以统计稳健的方式识别相当微妙的结构差异，例如探针的杂交状态。凭借面向复用和高通量分析的显著潜力，我们的研究指向一种快速、易用且兼容即时检测（point of care）环境的新型单分子DNA检测技术。
引用
@article{arxiv.1808.01168,
title = {An All-Electric Single-Molecule Hybridisation Detector for short DNA Fragments},
author = {Amelia Y. Y. Loh and Claire H. Burgess and Diana A. Tanase and Giorgio Ferrari and Martyn A. McLachlan and Anthony E. G. Cass and Tim Albrecht},
journal= {arXiv preprint arXiv:1808.01168},
year = {2018}
}