蛋白质热力学双状态合作性的聚合物原理

实验热力学双状态准则要求在折叠/unfolding 过渡中点附近的van't Hoff 焓 $\Delta H_{\rm vH}$ 等于或非常接近整个过渡的热力学焓 $\Delta H_{\rm cal}$。我们使用来自chymotrypsin 抑制剂2的实验参数构建解析模型，以阐明热力学分析中使用的几种不同van't Hoff 焓之间的关系。在合理的假设下，这些 $\Delta H_{\rm vH}$ 约等于 $\Delta H_{\rm cal}$ 的含义是等价的：实际蛋白质中构象失去的焓差异远小于某些以前的格子模型估计的值，这表明能量景观理论中“折叠到玻璃转变温度比值” $T_{\rm f}/T_{\rm g}$ 可能超过6.0。几种流行的三维格子蛋白质模型，具有不同的残基类型在其字母表中，均未达到 calorimetrically 双状态的高实验标准。一些模型假设native 状态具有多个构象，具有在unfolding 过渡温度以下显著的未失去的能量波动，以及/或预测在过渡点之上显著的连续构象扩张在denatured ensemble中。