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具有瓶颈的 ASEP 相图与边界效应

元胞自动机与格子气 2009-11-13 v1

摘要

我们研究了存在瓶颈(即具有降低跳跃速率的连续缺陷位点序列)情况下的完全不对称简单排斥过程(TASEP)。通过计算机模拟和一种新的解析方法,我们研究了此类瓶颈对相图的影响。我们发现,流和相图性质不仅明确依赖于瓶颈的长度,还依赖于其位置。对于靠近边界的瓶颈,这激发了有效边界速率的概念。此外,在远离第一个瓶颈的位置引入第二个较小的瓶颈对输运能力没有影响。这些结果将构成无序 TASEP 有效描述的基础,并适用于蛋白质合成或细胞内输运系统的建模,在这些系统中分子马达的运动受到固定阻塞分子的阻碍。

关键词

引用

@article{arxiv.0711.3103,
  title  = {Phase diagram and edge effects in the ASEP with bottlenecks},
  author = {Philip Greulich and Andreas Schadschneider},
  journal= {arXiv preprint arXiv:0711.3103},
  year   = {2009}
}

备注

accepted by Physica A