细胞内输运最小模型中的瓶颈诱导转变
统计力学
2007-05-23 v1 无序系统与神经网络
生物物理
摘要
我们考虑无序对细胞内输运最小模型的非平衡稳态的影响。在该模型中，粒子根据完全非对称排斥过程（TASEP）单向运动，并通过朗缪尔动力学与体储库耦合。我们的讨论集中于作为粒子输运瓶颈的局域点缺陷。结合解析方法和数值模拟，我们确定了作为缺陷强度函数的丰富相行为。我们的解析方法依赖于一种有效的平均场理论，该理论通过将晶格分成两个子系统获得，并利用局域电流守恒有效地连接起来。引入承载能力（即能流过系统主体（包括缺陷）的最大电流）这一关键概念，我们区分了缺陷无关紧要的情况和缺陷作为瓶颈并诱导各种新相（称为瓶颈相）的情况。与存在非均匀性的简单TASEP相反，出现了许多情景，并转化为丰富的底层相图，我们讨论了其拓扑性质。
引用
@article{arxiv.cond-mat/0604356,
title = {Bottleneck-induced transitions in a minimal model for intracellular transport},
author = {P. Pierobon and M. Mobilia and R. Kouyos and E. Frey},
journal= {arXiv preprint arXiv:cond-mat/0604356},
year = {2007}
}
备注
14 pages, 15 figures, 1 table