一种新的不变量方法在同质和非同质四叉树上的性能
种群与进化
2007-05-23 v1
摘要
在80年代末和90年代初，几位作者尝试使用系统发育不变量进行树重建（最初的想法源于Lake以及Cavender和Felsenstein在1987年的工作）。然而，基于不变量方法的效率仍然受到质疑，这可能是因为这些方法只使用了系统发育不变量集合中的少数生成元。本文研究的方法最初由Casanellas、Garcia和Sullivant提出，是第一种基于不变量并使用DNA数据全生成元集合的方法。本文进行的模拟研究证明，它是一种非常有竞争力和高效的系统发育重建方法，特别是对于系统发育树上的非同质模型。
引用
@article{arxiv.q-bio/0610030,
title = {Performance of a new invariants method on homogeneous and non-homogeneous quartet trees},
author = {Marta Casanellas and Jesus Fernandez-Sanchez},
journal= {arXiv preprint arXiv:q-bio/0610030},
year = {2007}
}
备注
12 pages and 4 pages of Supplementary Material included, 8 figures. to appear in Molecular Biology and Evolution