随机切换朗之万系统中有效热平衡的 Numerical 计算
统计力学
2024-01-17 v2 概率论
摘要
在蛋白质等主动因子作用下的生物系统模型中，随机切换力项频繁出现。切换力与布朗运动的相互作用即使在不服从势函数的系统中也能创造“有效热平衡”。为了扩展能量景观分析领域以理解切换系统中的稳定性和转变，我们推导了定义这一有效平衡的准势，适用于具有按连续时间马尔可夫链过程切换的力的通用过阻尼朗之万系统。结合用于计算最可能转变路径的弦方法，我们将方法应用于一个理想化系统，并展示了先前未报道的数值挑战的出现。我们提出对算法的修正以克服这些挑战，并通过证明我们计算的准势势垒与系统中渐近蒙特卡洛转变时间的一致性来显示其有效性。
引用
@article{arxiv.2104.13271,
title = {Numerical computation of effective thermal equilibrium in Stochastically Switching Langevin Systems},
author = {Benjamin L. Walker and Katherine Newhall},
journal= {arXiv preprint arXiv:2104.13271},
year = {2024}
}
备注
22 pages, 5 figures