基因调控与神经计算网络拓扑结构及其动力学效应

我们研究了两种不同类型的有向网络：转录调控网络和神经网络。对有向网络结构进行了研究，也表明其反映了网络上发生的不同过程。将影响分布（即下游顶点的数量）作为研究随机顶点删除的工具。我们观察到，在转录调控网络中，只有少数顶点具有大影响力。大多数顶点的低影响力限制了随机删除的影响，通常仅在少数顶点上体现。神经网络的拓扑结构与影响分布 differ,大多数顶点的影响力都较大。为进一步研究顶点删除的效应，我们模拟了网络上的生物过程。与预期的神经网络随机顶点删除具有大效应相反，高密度的边以及所使用的动力学使得系统状态的变化高度局限于被删除的顶点附近。