蛋白质网络拓扑的特异性与稳定性
软凝聚态物质
2009-11-07 v1 统计力学
q-bio
摘要
分子网络在多个层面指导着活细胞的生化过程：其代谢和信号通路均由相互作用蛋白质网络塑造，而蛋白质的合成则由基因调控网络控制。为探讨这两种网络的拓扑属性，我们量化了相互作用节点之间连通性之间的相关性，并将其与一种 null 模型（其中所有链接均随机重排）进行比较。我们发现，对于相互作用网络和调控网络而言，连接高度连通蛋白质之间的链接被系统性地抑制，而连接高度连通蛋白质与低连通蛋白质之间的链接则被偏好。这一效应降低了不同功能模块之间交叉沟通的可能性，从而增加了网络整体对有害扰动的鲁棒性。
引用
@article{arxiv.cond-mat/0205380,
title = {Specificity and stability in topology of protein networks},
author = {Sergei Maslov and Kim Sneppen},
journal= {arXiv preprint arXiv:cond-mat/0205380},
year = {2009}
}
备注
17 pages, 7 figures