toehold 介导的 RNA 链置换建模
生物物理
2015-03-11 v1 软凝聚态物质
化学物理
生物大分子
摘要
我们利用最近开发的 RNA 粗粒化模型研究了 RNA toehold 介导的链置换反应的热力学和动力学。链置换是指单链置换先前结合到互补底物链上的不同链的过程，这是活性核酸纳米技术中的一种基本机制，也被假设在体内发生。我们研究了置换反应速率作为 toehold 长度和温度的函数，并做出了两个可实验验证的预测：如果 toehold 位于底物的 5' 端，则置换更快；对于较长的 toehold，置换速度随温度升高而减慢。
引用
@article{arxiv.1411.3239,
title = {Modelling toehold-mediated RNA strand displacement},
author = {Petr Šulc and Thomas E. Ouldridge and Flavio Romano and Jonathan P. K. Doye and Ard A. Louis},
journal= {arXiv preprint arXiv:1411.3239},
year = {2015}
}